Struktur Organisasi Baperlitbang Pohuwato, terdiri dari :
<! Sekretariat >
- Sub Bagian Kepegawaian dan Umum
- Sub Bagian Keuangan
- Sub Bagian Perencanaan
<! Bidang Perencanaan Dan Monev >
- Sub Bidang Perencanaan
- Sub Bidang Data, Monioring dan Evaluasi
<! Bidang Fisik,Prasarana dan Lingkungan >
- Sub Bidang Infrastruktur Publik dan Lingkungan Hidup
- Sub Bidang Infrastruktur Dasar
<! Bidang Ekonomi dan Sosial Budaya >
- Sub Bidang Ekonomi dan Kerjasama antar Daerah
- Sub Bidang Sosial Budaya dan Kerjasama antar Lembaga
<! Bidang Penelitian Dan Pengembangan >
- Sub Bidang Litbang SDM,Budaya Dan Pemerintahan
- Sub Bidang Litbang SDA,Ekonomi Dan Lingkungan